Pour mieux définir la pharmacognosie, elle peut être pensée comme un collecteur pluridisciplinaire. C'est une discipline qui s'occupe de la reconnaissance :
médicaments, c'est-à-dire connaître la source, les aspects morphologiques macro et microscopiques de chaque médicament ;
du médicament et de la source même après les procédés de fabrication, par exemple le séchage ;
l'authenticité et la contamination des médicaments, à partir d'une analyse de ses composants caractéristiques ;
contamination ou adultération du médicament, sachant que les deux affectent sa qualité, qui ne sera plus excellente.
Le processus de reconnaissance nous amène à identifier la bonne origine et l'authenticité du médicament, à évaluer toute fraude appliquée au médicament lui-même et à exprimer un jugement de qualité qui dépend également de "l'identification du médicament lui-même. Si la reconnaissance suppose des critères d'évaluation de type botanique, par exemple les tissus, associés à une classification macro et microscopique du médicament, suppose également des évaluations de type microbiologique, visant à évaluer, encore une fois, la qualité de l'usage bénéfique pour la santé du médicament.
Si un certain médicament a des propriétés antivirales, comme l'échinacée, une fois reconnue macro et microscopiquement, ses propriétés sanitaires doivent être évaluées ; en effet, il peut arriver que la plante dont le médicament est issu ait été mal cultivée, dans des conditions atmosphériques inadaptées et qui ne permettent pas le développement de principes antiviraux.Pour évaluer tout cela, il est nécessaire d'examiner l'efficacité du médicament in vitro, au moyen de tests microbiologiques. Si une certaine quantité de médicament doit déterminer un certain résultat, je vais tester pour voir s'il a de très bonnes, bonnes, peu ou pas de propriétés. Des évaluations chimiques sont également nécessaires, surtout si je dois déterminer à quel point ce médicament est antiviral. J'ai besoin de connaître les modèles d'extraction et d'identification les plus adaptés pour évaluer les principes actifs, donc les critères d'évaluation de la phytochimie. Si je sais quelle quantité d'ingrédient actif par unité de poids je dois obtenir avec la meilleure méthode d'extraction, je peux évaluer si le médicament est excellent, bon ou de faible valeur et déterminer s'il a été cultivé dans des conditions inappropriées, traité ou contaminé par pesticides inhabituels ou s'il a subi une dégradation post-récolte. Une évaluation doit donc également être faite sur la base de la caractérisation chimique du médicament. Enfin, je peux et dois évaluer si le médicament peut être toxique pour l'organisme humain ; les valeurs de toxicité sont déterminées in vitro, in vivo sur le cobaye et également à un niveau clinique sur l'homme, afin d'esquisser un large éventail de valeurs de toxicité.
Ces outils servent à la pharmacognosie pour tracer une image complète de l'identification du médicament dans sa qualité et son identité pour son application saine. La pharmacognosie peut donc être définie comme un sujet pluridisciplinaire qui fait appel à des aspects de type botanique, chimique, biologique, toxicologique et microbiologique, pour déterminer l'identité et la qualité du médicament au niveau microscopique et macroscopique, phytochimique, biologique et toxicologique.
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