Le cytoplasme est la substance, avec une structure colloïdale prédominante, entre la membrane plasmique et la membrane nucléaire.
Des molécules de plus petits métabolites sont dissoutes dans le cytoplasme : les macromolécules. Ceux-ci peuvent rester à l'état de solution ou de gel, provoquant ainsi des modifications de la fluidité cytoplasmique.
Le cytoplasme comprend toutes les substances fonctionnelles de la cellule (le protoplasme) à l'exception du noyau ; il se compose d'une solution aqueuse d'enzymes et d'autres macromolécules, d'ATP, de porteurs d'électrons, d'acides aminés, de nucléotides et de substances inorganiques, telles que les phosphates, le sodium et le potassium, en grande partie sous forme d'ions. De telles enzymes facilitent les réactions chimiques généralisées. Cependant, lorsqu'il s'agit d'enzymes qui pourraient provoquer la démolition de structures cellulaires organisées, ou qui nécessitent un arrangement spatial ordonné, alors leur siège n'est pas dans le cytoplasme mais à l'intérieur d'organites particuliers.
Le cytoplasme est divisé par un réseau de membranes, appelé réticulum endoplasmique, qui se poursuit avec la membrane externe de l'enveloppe nucléaire, qui a la même structure de base que la membrane cellulaire et les membranes nucléaires.Le réticulum endoplasmique divise la cellule en compartiments séparés, permettant à la cellule elle-même de différencier différents produits chimiques et activités. La plupart des enzymes qui exercent ces activités font partie de la structure des lipoprotéines des membranes qui forment le réticulum endoplasmique. Les nombreux plis du réticulum endoplasmique représentent une surface sur laquelle de nombreux les réactions biochimiques cellulaires ont lieu.
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